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主要是購買玉米秸稈等草料進行再加工，飼養牛、羊、豬，飼養牛、羊、豬并屠宰，分部分出售。有時會購買活豬。如何報稅？根據哪個行業？
1.自行繁殖育肥牲畜的動物，應按銷售前發生的必要費用，借記“消耗性生物資產”，貸記“銀行存款或現金”等科目。2.銷售種用育肥畜，應按實際收到的金額，借記“銀行存款或現金”等科目，貸記“主營業務收入”等科目。根據其賬面余額，借記“主營業務成本”等科目，貸記“消耗性生物資產”。已經計提折舊的，也應當同時結轉。3.本科目核算企業(農業)持有的消耗性生物資產的實際成本。本科目期末借方余額，反映企業(農業)消耗性生物資產的實際成本。牲畜或役用動物經淘汰后轉為育肥動物的，應按畜群轉移時的賬面價值，借入“消耗性生物資產”，按累計折舊計提，并按其賬面余額，借入“生產性生物資產累計折舊”，進行貸款。已經計提減值準備的，應當同時結轉減值準備。4.育肥畜轉化為生產用畜或役用畜的，應按其賬面余額，借記“生產用生物資產”科目，貸記“消耗用生物資產”科目。已經計提折舊的，也應當同時結轉。5.根據各車間發生的直接材料、直接人工等費用，借記：農業生產成本——孵化車間、屠宰車間、養殖車間等借款：銀行存款、現金、原材料、應付工資等科目。
生物資產會很多，存貨的子目錄會很復雜。納稅申報就是賣豬、羊之類的，按照賣的貨物申報增值稅！你有服務業嗎？具體免稅政策可以參考注冊會計師稅法介紹！
這個問題你基本可以寫一本了，太多了，涉及：養殖業，屠宰加工業，商業企業等等。
根據描述，如果把養殖、屠宰、加工、收購合為一家公司，只能說明要么公司不懂稅收政策，要么企業太小。
生產和銷售農產品的單獨的種植業，可以免征增值稅和企業所得稅。
在生豬屠宰加工行業，銷售初級農產品必然是增值稅，但可以免征企業所得稅；同時，購買的生豬可以抵扣進項稅。
如果幾個行業沒有分開，如果要享受增值稅和企業所得稅，需要單獨核算。單獨核算會增加核算的難度，可能會給企業享受優惠政策帶來不便。但如果把養殖和加工分成兩個企業，一切就迎刃而解了。
至于提到的核算，難點在于成本核算，一個養殖過程的成本核算，屠宰加工環節的成本核算。類似的問題我已經分享過很多次了，大家可以搜索一下。
(1)母豬懷孕期間的相關成本費用(包括折舊)分攤到產仔當月的活仔豬成本中，月末未產仔的不予核算。會計處理如下：
借：原材料
生產費用
貸款：應付賬款/銀行存款
借：生產成本-生產中的播種成本
貸款：原材料
生產成本-制造成本
借：消耗性生物資產-乳豬
貸：生產成本-生產中的播種成本
(2)乳豬出生后，在產房哺乳期間，因牲畜和乳豬出生而發生的成本和費用，直接分攤到乳豬成本中，會計處理如下：
借：消耗性生物資產-乳豬
貸：生產成本
(3)乳豬斷奶后轉入保育舍時，按t的賬面成本結轉二級明細
借：消耗性生物資產——種豬
貸：生產成本
(5)育成豬轉入育肥舍時，根據育成豬的賬面價值結轉二級明細賬。
借：消耗性生物資產——育肥豬
貸款：消耗性生物資產-生長豬
進入育肥豬階段后的成本處理
借：消耗性生物資產——育肥豬
貸：生產成本
(6)銷售育肥豬時，會計處理如下：
借方：應收賬款
貸款：主營業務收入
借方：主營業務成本
貸款：消耗性生物資產-育肥豬